不光是化学，除了数学比较特殊，基本其他学科的所有理论都有其应用局限性啊，理想的大一统理论还有待于搞数学和物理的同胞们艰苦奋斗呢~

这些理论的局限性并不被看作是错误，而是对于同一事物的不同观察角度的限制。就像题主说的价键理论和分子轨道理论对于特殊事例的解释问题，这两个理论都是人们抽象出的理论模型，都是从一个特定的角度观察原子/分子电子结构，但这不代表原子/分子的电子结构就和这两个模型一样，非此即彼。

就像光具有波粒二象性，用不同的方法观测会分别体现出“波”和“粒子”这两个理论模型的特点，但你不能说光要么是波要么是粒子，另一个是错的。因为我们要了解一个事物必须通过观察的手段，而观察世界的方法是有局限的，所以我们对事物的描述和定义也就具有局限性。所以，光“既是波，也是粒子”。

说白了就是书上的那个例子，盲人摸象。因为没法直接看到全部的“象”，所以说“象”是“像柱子一样的东西”、“像扇子一样的东西”、“像管子一样的东西”。。。的集合。这个说法也没错吧，只是有局限性而已。